Самая популярная и общепринятая теория о происхождении чихуа хуа связывает появление этой породы с историей древних индейских племён майя, тольтеков и ацтеков.

Очень немногое известно о породе времён культуры майя. Есть сведения, что уже в 5 веке н.э. на территории сегодняшней Мексики существовали "течичи" - маленькая длинношёрстная собака с тяжёлым костяком и, возможно, немая, которая являлась частью культуры тольтеков, пришедшей к ним, быть может, ещё и от более древних племён инков.
Это, предположительно, и был предок современного чихуа-хуа.
Течичи времен тольтеков запечатлены в резьбе на камне в монастыре Уэхотсинго, неподалёку от шоссе, ведущего из Мехико в Пуэбло. Этот монастырь был основан францисканскими монахами в 1530г и построен из каменных плит пирамиды Чолула, сложенной индейцами племени тольтеков.
Такие же рисунки с изображением предков чихуа хуа - течичи были найдены на полуострове Юкатан в древнем городе индейцев Чичен-Ица. В этих миниатюрах легко узнаваема современная чихуахуа. В 1850 г были найдены многочисленные останки этих собачек при раскопках поселения Тулу, полблизости от современного Мехико и развалин дворца последнего императора ацтеков - Монтесумы, рядом с Каса-Гранде - мексиканской провинцией Чи хуа хуа.

Другие историки утверждают, что современная чихуа появилась в результате смешения течичи с маленькой бесшёрстной собачкой, появившейся с востока, скорее всего из Китая, через существовавший в те времена перешеек между двумя континентами, находившийся на месте сегодняшнего Берингова пролива.

Цивилизация индейских племён является, пожалуй, самой загадочной на всём земном шаре, а почитаемые ими маленькие собачки играли огромную роль в религиозной и мистической жизни индейцев. Тольтеки были завоёваны ацтеками, и в результате на несколько столетий маленькая собачка становится призом или игрушкой для очень богатых людей.
Ацтекская знать была без ума от этих крошечных собачек, и даже когда хозяин умирал, он не расставался с ней - собаку приносили в жертву богам, сжигая вместе с останками хозяина, считая, что человеческие грехи перейдут к собаке, которая являлась как бы проводником души своего хозяина через подземный мир мёртвых, освещая его путь своими блестящими рубиновыми глазами, отгоняя злых духов и приводя её туда, где она обретала вечный покой.
Цивилизация ацтеков существовала 500 лет до тех пор, пока испанские завоеватели во главе с Кортесом не покорили эту страну в начале 14-го столетия.

Немного известно о чихуа хуа с 14 до 19 столетия. Существуют записи, что эти маленькие собачки находились на грани исчезновения и в основном использовались для употребления в пищу как мясное блюдо.

Около 1800 г. нескольких чихуахуа нашли в собственности у крестьян, проживавших недалеко от руин замка последнего монарха ацтеков императора Монтесумы.
Эти собачки имели родничок (малеру) - не окостенелое место в середине черепа, хорошо развитые пальцы, большие выразительные глаза, что характерно для современных чихуа-хуа.
Примерно в это же время такие же собаки были обнаружены и в других частях страны, а именно, на аризонских и техасских просторах и им давали характерные имена: "мексиканская собака", "аризонская собака", "техасская собака".
Американские путешественники стали завозить этих крошечных собачек в страну в качестве сувениров, в основном, из мексиканского штата Чихуахуа. Отсюда и закрепилось постоянное название породы.